该系统覆盖宜昌至宜宾段长江干流和长江重要支流，原拟于５月２６日投入运行。四川汶川地震发生后，位于灾区水文局的部分水情报汛站通讯全部中断，无法正常监测和报汛，使人们对流域降雨情况、震区水库运行情况、是否有地震带来的山体滑坡堵塞河床等信息一无所知。在此情况下，四川省水文局紧急启用刚安装完成的三峡水情自动测报系统，每天按时把水、雨情信息发送到接收中心，为抗震救灾提供了决策依据。

    设在都江堰水文站的三峡水情自动测报系统，其站房虽已倒塌，但设备仍工作正常，每小时１２个水位和雨量数据通过北斗卫星及时传递到成都水情分中心和四川省水情中心及各级防汛指挥部门。国家防总及时掌握了该站流量并由此推断出紫坪铺水库的下泄流量。北川水文站地震后水位骤降３０余厘米，流量明显变小，有关部门推断其上游河段有塌方阻塞河道的可能。

    类似于都江堰水文站、北川水文站情况的还有平武、甘溪、南坝、白什、雎水关、杨柳坪等水情站，都通过三峡水情自动测报系统将水情信息及时采集并传送到各级水情中心及政府各部门，为抗震救灾做出了贡献。